当论文查重率过高时，首先要冷静分析原因。可能是因为文献引用、相似度高等原因导致。其次，查看论文查重报告，对比原文和重复部分，准备好申诉材料。接着，按照学校或期刊规定的申诉流程，逐步提交申诉材料，陈述清楚申诉理由。最后，耐心等待学校或期刊的处理结果，积极配合调查。

论文查重率过高可能会对作者造成不良影响，因此及时有效地申诉是非常重要的。在申诉过程中，要保持理性沟通，遵守相关规定，提供充分的证据支持自己的观点。同时，也要注意避免抄袭、剽窃等行为，保持学术诚信。通过合理的申诉，作者有望得到公正的处理，维护自身的学术声誉和权益。